Πραγματοποιήθηκε η κλήρωση του πρωταθλήματος Νέων της Football League και το αναλυτικό πρόγραμμα του Ομίλου στον οποίο μετέχει ο Ηρακλής έχει ως εξής:
1η Αγωνιστική (25/11/18) – 8η (27/1/19)
Απόλλων Λάρισας-Δόξα Δράμας
Κέρκυρα-Καραϊσκάκης
Βόλος-Απόλλων Πόντου
Ηρακλής-Αιγινιακός
2η Αγωνιστική (2/12/18) – 9η (3/2/19)
Κέρκυρα-Απόλλων Λάρισας
Δόξα Δράμας-Βόλος
Καραϊσκάκης-Ηρακλής
Αιγινιακός-Απόλλων Πόντου
3η Αγωνιστική (9/12/18) – 10η (19/2/19)
Απόλλων Λάρισας-Βόλος
Ηρακλής-Κέρκυρα
Αιγινιακός-Δόξα Δράμας
Απόλλων Πόντου-Καραϊσκάκης
4η Αγωνιστική (16/12/18) – 11η (17/2/19)
Ηρακλής-Απόλλων Λάρισας
Βόλος-Αιγινιακός
Κέρκυρα-Απόλλων Πόντου
Δόξα Δράμας-Καραϊσκάκης
5η Αγωνιστική (6/1/19) – 12η (24/2/19)
Απόλλων Λάρισας-Αιγινιακός
Απόλλων Πόντου-Ηρακλής
Καραϊσκάκης-Βόλος
Δόξα Δράμας-Κέρκυρα
6η Αγωνιστική (13/1/19) – 13η (3/3/19)
Απόλλων Πόντου-Απόλλων Λάρισας
Αιγινιακός-Καραϊσκάκης
Ηρακλής-Δόξα Δράμας
Βόλος-Κέρκυρα
7η Αγωνιστική (20/1/19) – 14η (10/3/19)
Καραϊσκάκης-Απόλλων Λάρισας
Δόξα Δράμας- Απόλλων Πόντου
Κέρκυρα-Αιγινιακός
Βόλος-Ηρακλής
